Са.314 не понравились морским летчикам. Характеристики нагруженных машин с запасом топлива, бомбами или торпедой никуда не годились. Техническая комиссия, занимавшаяся этой проблемой, предложила облегчать самолеты, демонтируя нижние огневые точки и бронирование пилотской кабины. Таким способом удавалось выгадать всего 250 кг.

Почти все из 407 новейших "Капрони" отправили в подразделения фронтовой авиации, где они использовались с наибольшей отдачей. На Са.314 воевали 30-я штурмовая группа в Северной Африке, 20-й и 21-й полки поддержки сухопутных войск. Две вспомогательных группы "триста четырнадцатых" - 64-я и 76-я находились на юге оккупированной Франции в Ирэ, Люке и Кюр-Пьерфу. Итальянцы применяли Са.314 на всех фронтах, кроме восточного.

Несколько "триста четырнадцатых" служили в подразделениях отработки торпедо- и бомбометания, а также в NAI для подготовки экипажей тяжелых ночных истребителей "Дорнье" Do 217 J-2. Перехватчик Са.314 с мощным прожектором в носу участвовал в учениях по поиску цели ночью с помощью наземных РЛС и сети постов наведения, охватывавшей к осени 43-го весь север Аппенинского полуострова.

На 8 сентября 1943 г, когда свободная от "дуче" Италия вышла из войны, в ВВС страны насчитывалось 148 Са.314 и 53 Са.313. 40 из них -в штурмовых полках. Множество "Капрони" уничтожили во время перемирия. Но около десяти Са.313 и Са.314 из 103-й эскадрильи поддержки вместе с четырьмя из шести уцелевших.

Война и Советским Союзом также не принесла планируемых успехов, да и сами итальянцы не имели большой радости воевать, ни в жаркой Африке, ни в холодной России. Деятельность Са.314 ограничилась только полетами над Италией, где в середине 1943 года оставшиеся самолёты и дождались перемирия.

Большая часть бомбардировщиков, при этом, осталась в руках немцев на севере страны. По прямому назначению Luftwaffe использовать их не рискнуло, ограничившись передачей Са.314 в учебные части. О том, что Са.314 можно применять как штурмовик немцы вспомнили только в декабре 1943 года. На тот момент их штурмовые соединения оказались настолько потрепанными, что в дело пошла практически любая пригодная техника. До появления новых немецких штурмовиков из итальянских самолётов временно была создана группа NSGr.9, двухэскадрильного состава. В первую эскадрилью вошли Са.314 с десятью экипажами из NSGr.3, а вторую оснастили истребителями Fiat CR.42, приспособленными для штурмовых ударов. До весны 1944 года немцы базировались на аэродроме под Турином и летали на итальянских самолётах, пока в апреле группа не была переоснащена на Ju-87D-3. По всей видимости, последние Са.314 опять попали в учебные и транспортные эскадрильи, где и оставались до самого конца войны.