Модель G.12 "Gondar" была специальным вариантом с большой дальностью полета, предназначенным для работы на линиях сообщения с итальянской Восточной Африкой. За ней последовали три транспортных самолета G.12 GA, также оснащенных дополнительными баками с горючим. В конце 1942 и начале 1943 гг. были построены по одному экземпляру модели G.12 RT и G.12 RTbis, предназначенных для полетов между Римом и Токио. Первый имел дальность 8000 км, второй - 9000 км.

Основным военным вариантом был самолет G.12T. В его задачи входило осуществление регулярных транспортных перевозок между Италией и Северной Африкой, где особенно пригодилась большая дальность полета G.12. Эти самолёты оказались просто незаменимы при эвакуации итальянских войск из Туниса, но если предыдущие полтора года транспортники отлетали почти без потерь, то к весне 1943 года ситуация резко поменялась не в лучшую для Италии сторону.

Налаженный осенью 1942 года воздушный мост между Италией и Северной Африкой рушился буквально на глазах. Самые тяжелые дни для транспортной авиации стран оси наступили с марта 1943 г. Так, 5 апреля, в ходе серии налетов В-17, на аэродромах Палермо и Трапани сгорело 14 транспортных самолётов. Тем же днем 11 SM.82 и 5 Fiat G.12, едва успев прибыть на тунисский аэродром Эль-Аоуина, попали под бомбы 20 американских бомбардировщиков В-24. На лётном поле были сразу уничтожены две "Савойи" и три "фиата". Также пострадали ещё 12 немецких самолётов, 8 из которых не подлежали ремонту. 19-е апреля стало "судным днем" для G.12 - поднявшись с итальянского аэродрома смешанная группа из одного SM.75 и 12 SM.82 и G.12 так и не сумела достичь тунисского берега, потеряв все самолёты на подлете к нему. Вторую группу из 18 итальянских и немецких транспортных самолётов пытались прикрыть 12 МС.200 и МС.202, но и здесь удача отвернулась от них. В ходе боя с истребителями союзников были сбиты ещё 7 машин. Вынести подобные потери сильно поредевшая итальянская транспортная авиация не могла, хотя полеты в Африку продолжались вплоть до мая 1943 года, когда положение оставшихся там войск было безнадежным.

С разделением Италии в сентябре 1943 года на два государства G.12 продолжали служить обеим сторонам, а после войны уцелевшие самолеты G.12 использовались Военно-воздушными силами Италии в качестве транспортно-курьерских.

Производство было вскоре продолжено, и последними из построенных вариантов стали модель G.12CA - гражданский авиалайнер с двигателями Alfa Romeo 128 RC.18 мощностью по 850 л. с. и модель G.12L с удлиненным фюзеляжем, вмещающая 18 пассажиров и с моторами Fiat A.74 RC.42 мощностью по 870 л. с. . Самолет G.12LP был оснащен двигателями Pratt & Whitney R-1830-S1C3-G, а G.12LB - двигателями Bristol "Pegasus" 48.

5 мая 1947 года в небо поднялся первый самолет авиакомпании Alitalia, G.12, который осуществил перелет из итальянского города Турина в Рим, следующим же был рейс из Рима в Катанию.

К моменту завершения производства в 1949 г. было построено в общей сложности 104 самолета всех вариантов.