Первый полет S.41 состоялся 2 апреля 1912 года. Его пилотировал военный летчик Чарльз Самсон. После первых испытательных полетов самолет вернули компании для доработки. Главным образом были модифицированы крылья самолета - их сделали складывающимися, для удобства размещения  на корабле. Уже в таком виде S.41 передали RNAS, где ему присвоили бортовой номер "10". Самолет использовался в основном для отработки различных новшеств, в том числе и для испытаний бортовых радиостанций.

Успешная эксплуатация S.41 повлияло на решение Адмиралтейства заказать еще два подобных самолета S.51 и S.52 (бортовые номера 20 и 21, соответственно). Они впервые поднялись в воздух в апреле 1913 года.

Все три самолета использовались в первые месяцы войны для патрулирования прибрежных районов Великобритании.