В начале Великой Отечественной войны капитан А. А. Аверьянов служил в составе 45-го авиационного полка ( ВВС Южного фронта ), командовал эскадрильей. Отличился во время боёв за Северный Кавказ.

Войну закончил в составе 266-го истребительного авиационного полка, имея на личном счету не менее 5 сбитых вражеских самолётов. Награждён орденами Красного Знамени, Отечественной войны 1-й степени, медалями.