Родился 15 мая 1908 г. в поселке Шаpко-Бакумовка Панинского pайона Воронежской области, в семье крестьянина. Русский. Окончил 4 класса. Батрачил. Затем был председателем сельсовета.

В РККА с 1930 г. Член ВКП(б) с 1931 г. В 1933 г. окончил Луганскую военную школу летчиков им. Пролетариата Донбасса, а в 1934 г. - курсы командиров звеньев. Был командиром звена 109-й эскадрильи 36-й истребительной авиабригады.

Участвовал в национально-революционной войне в Испании с 13.10.36 по 13.11.36 гг. Прибыл в Испанию на пароходе «Карл Лепин» в составе группы советских летчиков под командованием капитана Рычагова.

Командовал отрядом истребителей И-15 на Центральном фронте, прикрывал Мадрид от налетов авиации противника. В воздушных боях сбил 5 самолетов противника.

13 ноября 1936 г. он погиб при отражении воздушного налета на Мадрид.

31 декабря 1936 г. лейтенанту Ковтуну Карпу Ивановичу было присвоено звание Героя Советского Союза посмертно.

Похоронен в Испании на деревенском кладбище в 12 км от аэродрома Алькала-де-Энарес.