Передняя часть фюзеляжа AN.66 представляет собой сэндвич-конструкцию из стекловолокна, а задняя часть - полумонокок из фанеры и бальзы, и оснащена V-образным хвостовым оперением типа «бабочка». Шасси - убирающееся моноколесо, а пилот сидит под длинным, плотно прилегающим прозрачным фонарем кабины.

AN.66С имел тот же фюзеляж, что и AN.66-2, но с совершенно новым крылом изменяемой геометрии со специальным аэродинамическим закрылком, который можно выдвинуть, увеличив площадь крыла примерно на 20%. V-образное хвостовое оперение Ан-66-2 заменено обычным хвостовым оперением с низко расположенным стабилизатором, аналогичным стабилизатору Standard Elfe S-3.

Летные испытания прототипа AN.66С начались в Буцвайлерхофе в Германии 11 сентября 1973 года. Планер получил новое крыло с большим размахом - 23 м (75 футов 5 1/2 дюйма), а аэродинамические закрылки приводятся в действие цепным приводом с помощью рукоятки в кабине пилота и могут быть полностью выдвинуты или полностью убраны, без возможности промежуточного положения; в полностью выдвинутом или убранном состоянии профиль крыла изменяется таким образом, чтобы получить сплошной профиль Эпплера.